@summy aunque sea tarde te contesto. Una empresa en la que trabaje hizo el registro de marca y era un coñazo. Habia de dos tipos, uno que valia entre 50 y 100 euros, no lo recuerdo bien y otro que era casi 1000 euros. El primero era una especie de registro express que te autorizaba a usar el logo que presentabas y tenerlo como nombre comercial, pero en caso que alguien denunciara su uso tenias que retirarlo.
El segundo , el caro se aseguraba de que el nombre y el logo elegido no existian al menos en el territorio español como marca registrada y por tanto con ese registro nadie podia obligarte a cambiar tu marca o tener que modificarla.
Respecto a prestashop funciona muy bien y es muy modular y configurable. Pero tienes que tener un sistema de pago seguro (funciona muy bien con paypal) y si vendes al extranjero tener mucho cuidado con los impuestos y hacer bien los calculos o tendras sorpresas de hacienda.
Otra opcion muy potente es usar joomla+ virtuemarkt. Yo he trabajado con esta opcion y las posibilidades eran infinitas, el problema es que tienes que dominar joomla y ademas el virtuemarkt.
Pero ya te digo que conozco gente que usa prestashop y estan encantados con su funcionamiento. Ademas hay miles de plantillas de pago y gratuitas para personalizar el aspecto de tu web.
En ambas opciones hay que estar todo el dia encima de la pagina, mirando pedidos, mirando visitas, detectando posibles ataques, etc... Es decir que vas a necesitar un buen administrador de la pagina.