Yo no pero sí compañeros míos.
FPI son adjudicadas a proyectos y el encargado de dicho proyecto es el que decide para quién es la beca.
FPU son adjudicadas directamente a los candidatos.
A parte de esa diferencia, son más bien iguales. Creo que la cuantía de la beca es la misma. Ambas, por ejemplo, te dan la oportunidad de hacer estancias en Universidades del extranjero, con dinero extra para manutención, alojamiento y viaje. Las estancias antes eran de hasta 6 meses al año, ahora no lo tengo claro, y las convocatorias están tardando mucho en salir y en resolverse.